Rumah Sakit Bhayangkara Kupang berdiri tanggal 3 Juli tahun 1967 diatas tanah seluas 5.865 meter persegi yang berlokasi di jalan Nangka No, 84 Kupang NTT, adalah warisan dari gedung Komplek Komdak XVII Nusra yang direnovasi menjadi sebuah rumah sakit.
Status Rumah Sakit Bhayangkara Kupang berdasarkan Kep Wali Kota Kupang No.92 / KEP / HK / 2012 tanggal 09 Mei 2012 tentang pemberian Ijin Operasional Tetap Rumah Sakit Umum Tipe C Bhayangkara Kupang, Pada tanggal 26 Januari 2007 RS Bhayangkara Kupang mendapat Ijin Operasional Rumah Sakit dari Departemen Kesehatan RI No : YM.02.04.3.1.587. sebagai unit pelayanan kesehatan Polri di Daerah Nusa Tenggara Timur.
RS Bhayangkara Kupang juga telah memperoleh akreditasi Menkes, dengan Keputusan Menteri Kesehatan RI nomor : YM.01.10/III/6725/10 tentang pemberian status AKREDITASI PENUH TINGKAT DASAR, tanggal 11 November 2010. sampai sekarang telah melalui pentahapan pembangunan baik aspek organisasi, fisik dan sumber dayanya , serta telah lulus AKREDITASI KARS pada tanggal 14 September 2017.
Pada tanggal 9 April 2015 Rumkit Bhayangkara Kupang ditetapkan menjadi Badan Layanan Umum secara Penuh oleh Menteri Keuangan dengan nomor surat Keputusan Menteri Keuangan Nomor : 503/KMK.05/2015.
Dengan bermodalkan kepercayaan dan fanatisme masyarakat terhadap pelayanan rumah sakit dengan motto ”SENYUMMU ADALAH KEPUASANKU”, rumah sakit Bhayangkara Kupang selama lima tahun kedepan ini berusaha mencapai visinya yakni menjadi rumah sakit yang terpercaya pemberi pelayanan kesehatan prima di daratan Timor NTT.
Standarisasi pelayanan Rumah Sakit Bhayangkara Kupang merupakan tantangan terbesar dalam mewujudkan cita – cita tersebut, karena harus didukung oleh peningkatan kualitas seluruh sumber daya yang ada dengan anggaran yang cukup tinggi. Namun melalui efisiensi dan efektifitas di segala bidang serta semangat kebersamaan, Rumah Sakit Bhayangkara Kupang secara berkesinambungan, telah banyak melakukan perubahan, pembaharuan dan penyempurnaan untuk memberikan pelayanan terbaik sehingga keberadaannya dirasakan bagi masyarakat Polri.
Profil ini menggambarkan keadaan yang sebenarnya dengan harapan pada masa yang akan datang Rumah Sakit Bhayangkara Kupang senantiasa mampu meningkatkan kinerja yang lebih profesional.